在“一省两地”战略的指引下，1999年，海南省农业保持两位数增长，部分主要农产品产量再创历史新高，冬季瓜菜、海水养殖、海洋捕捞、热带水果等优势产业快速发展，农业现代化程度进一步提高，农业的基础地位继续得到加强。2000年，海南农业对经济增长的贡献率达43.4%，冬季瓜菜、热带水果、海水养殖等优势产业成为拉动农业经济发展的主要动力。省政府重点发展“以销定产、以产促销”的“订单农业”，各级农业部门多次到全国各大中城市进行市场调研，找客户、跑订单。为扩大海南农产品的外销量，省政府主办2000年（海口）全国冬季农副产品交易会，总成交额72.99亿元。2000年，全省热带水果、水产品出岛外销量分别达 42.5万吨和 40万吨，2000年至2001年，冬季瓜菜出岛销量155万吨。

与此同时，海南稳步推进农业产业化，取得了很大的进展。2001年，海南全省农业产业化组织有 254 个，带动 12 万农户的生产经营。在海南各种形式的产业化生产基地中，国家级和省级的 18家龙头企业年销售收入达8.76亿元，创汇 340万美元，与之相联的农户增收 7亿多元。全省涌现出各类农产品运销组织 1000多个，农产品运销的组织化程度大大提高。从 2001年起，海南省重点扶持发展一批有竞争优势和带动力强的龙头企业，制定 《关于大力推进农业产业化经营的意见》，出台扶持龙头企业发展的优惠政策，发挥龙头企业的市场主体作用，引导企业采取多种形式实现与农民对接，形成利益共享、风险共担的经营机制，增强了对农户的带动能力。