【土地资源】琼中县的土壤主要由花岗岩和少量紫色砂岩、砂页岩、安山岩风化而成。土壤类型多样，土深厚肥沃。按成土母质的不同，全县共分为南方山地灌丛草甸土、黄壤、赤红壤、砖红壤、红色石灰土、紫色土和水稻土7个土类，14个亚类，37个土属，103个土种。南方山地灌丛草甸土类分布于海拔1600米以上的高山顶部，成土母质为砂页岩风化物，面积257.33公顷，占自然土壤的0.12%，土层厚40厘米；黄壤土类分布于海拔750—1600米山地，成土母质为花岗岩或砂质岩的风化物，面积15471.4公顷，占自然土壤的7%，土层厚24—85厘米；赤红壤土类分布于海拔400—750米的山地，成土母质为花岗岩及砂质岩风化物，面积63349.8公顷，占自然土壤的28.7%，土层厚110厘米；砖红壤土类分布于海拔400米以下的低丘和台地缓坡，面积133005.8公顷，占自然土壤的60.4%，土层厚约100厘米。红色石灰土类分布于什运乡西部一带山丘，成母土质为石灰岩风化物，面积118.73公顷，占自然土壤的0.05%，土层厚度为54厘米；紫色土类分布于北部黎母山镇的松涛至大保村一带的低矮山丘，成土母质为紫色砂岩风化物，面积2823.93公顷，占自然土壤的1.3%，土层厚度62厘米；水稻土类零星分布在各乡镇的丘陵、台地，成土母质为山地或丘陵峡谷的洪积物，面积5369.67公顷，占自然土壤的2.43%，占全县总面积2%，占耕地面积的57.4%，土层厚度66厘米。

【动物资源】琼中县动物资源十分丰富，种类繁多。稀有珍贵野生动物主要有黑熊、长臂猿、猕猴、金钱豹、金钱龟、山鹿、孔雀雉、穿山甲、蟒蛇、毛鸡、原鸡、鹦鹉等。其中，金钱龟是食用滋补品，产量为全省之首。鸟类有300多种，主要有留鸟和候鸟，其中留鸟有鹭、鸠、啄木鸟、啄花鸟、鹬鸟、鹃鸟、鹰、莺鸟、燕、鹊鸟、画眉、鹛鸟等，候鸟有莺、鹬、鸫、翁鸟、鸥、鸲、野鸭、隼、鹞、沙锥、行鸟、鹳、鹨、杜鹃等。鱼类有竹鲍鱼、石鲮鱼、白鲢鱼、君鱼、梅鱼和鳗鱼等。溪鳗最大的重达20千克左右，鱼肉鲜嫩，味道甜美，营养丰富。淡水中还有珍贵的水獭、水龟、鳖等。节肢动物主要有虾、蟹、蜘蛛、蜈蚣、蝎子、蚰蜒等。两栖动物有37种，主要是青蛙、蟾蜍等。爬行动物主要有大头龟、眼斑水龟、蟒蛇、大眼镜蛇、金环蛇、坡甲、蜥蜴、壁虎等。软体动物主要有田螺、福寿螺、河蚌、蜗牛等。环节动物主要有蚯蚓、水蚂蝗、山蚂蝗。

【植物资源】琼中县地理位置独特，域内植物种类众多，分布有海南岛最典型、最齐全的热带山地森林，具有常绿、复层、混交、异龄、多树种组成等特点。全县植被属热带雨林、季雨林，林型多样，以热带常绿阔叶林为主，并具有明显的垂直分布带谱：1000—1300米为山地常绿阔叶林带，750—1000米为山地雨林或沟谷雨林带，500—750米为常绿季雨林带，500米以下为落叶季雨林和灌丛以及人工植被。主要珍贵植物有：红花天料木（母生）、苦梓、八角、胭脂、菠萝蜜、海南木莲（绿楠）、油丹、花榈木（花梨）、紫丹、坡垒、红壳松、陆均松、竹叶松、青梅、胆木、沉香、砂仁、白藤、益智等。

【矿产资源】琼中县已知的矿产有10种。其中，金属矿产有银、铅、锌矿等3种；非金属矿产有萤石、水泥用大理岩、饰面石材、建筑用石料、砖瓦用页岩、建筑用陆砂等6种；水气矿产有矿泉水等。全县55处矿产地中，中型矿床3处，小型矿床35处，矿点17处。金属矿分布零散，且以矿点矿床为主；建筑用花岗岩资源丰富。